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临床预测模型R语言实战-读书笔记

聂志强实战医学统计2023-05-17 00:14:22广东


本章思维导图:


前言

临床预测模型,近几年来很火。小编从2008年的薛微老师 SPSS Clementine入门机器学习,到后来SPSS升级为modeler,再到后来SAS EM,再到后来接触WEKA,KNIME,再到后来转战R语言,零零散散接触python。一路走来摸爬滚打也走了很多弯路,至今仍然觉得,这个方向其实是很庞大很庞大的黑洞,入门容易精通很难。

目前初级阶段的预测都停留在logistic、cox,然而尽管就这2模型也存在诸多衍生的家系模型、已经由此产生的各种图表绘制和坑。高级阶段的预测,会融入生信、组学、影像、运动感受器、波形音频等等各种形形色色数据,模型也会进阶到深度学习等等高阶模型。当然,需要的技能也涉及python等其他新型工具,也许看起来并没有尽头,因为统计模型永远在进化,我们追着他跑依然越来越远。我们只是在能利用的数据量空间,尽量用局部最优模型(SCI常见的经典成熟的模型、调参套路)来探索验证我们的发现。至于是否是全局最优模型,很难定论。

即使艰难如上,不妨碍这本书作为一个目前来说比较全面的新手入门,老手补缺(绘图提高)的读本。学会里面的代码,基本的SCI预测模型套路与绘图也差不多了。当然,这本书不完美(市面上也没有一本预测模型的书足够优秀),甚至算是推文帖子的汇总,一些章节顺序设计不够合理,一些知识点不够深入,但是不妨碍我推荐大家耐心读一读。起码,小编一口气连着3天码代码,修正代码,重现图表,学习到很多过去没有注意的地方。

如果你对全文感兴趣可以去微信公众号搜一搜《临床预测模型R语言实战》,作者:阿越就是我。本文ppt中代码,小编通读完后,加上了一部分解释并修正其中一些错误代码。

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临床预测模型R语言实战读书笔记

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