完美复现IF13分酷炫亮眼的环形柱状图

昨天群内发了一篇母校发的13分AJKD文章(PMID: 37678743)，小伙伴们对其中的一个复杂酷炫环形图十分感兴趣，纷纷提出想要复现。小编第一时间尝试多少次于是自己被迫复现了一遍，现在分享出来给小伙伴们(好好珍惜吧)。省的大家再自己花时间琢磨了(请把赞点出来)。

一、文章PICOS

文章亮点来自UKB队列，案例代码复现均来自小编手动逆向虚拟数据。福利在文末，需要的从速。

二、3点统计细节。

1. 效应量SMD

越来越多的大样本量研究开始注重SMD取代P值，其实很早顶刊们都要求提供SMD。SMD>0.1 说明，存在异质性，毕竟类似卡方值只要样本量够大P永远都是<0.001。SMD=Cohen’s d计算可以来自 (effectsize包)，但是计算结果与tableone包的SMD稍微不同，且前者无法计算分类变量的SMD。故，推荐 tableone包。

2. 环形柱状图

原图如下，看起来十分酷炫。

但是仔细解剖，其实就是许多代谢标志物，依据VLDL LDL HDL 的6水平 4水平 4水平进行组合绘制的径向环形图(环形柱状图)。这种当需要展示在柱形图中的数据变量较多时，我们可以考虑将直角坐标系转换为极坐标，通过环状的方式去呈现。重点来了，本文复原R代码和图形如下：

最终获取文献中G| A| S 三层的环形柱状图！如需复现代码和数据，见文末。

还有更加酷炫的动态环形图，https://jokergoooo.shinyapps.io/covid19。

代码来自https://jokergoo.github.io/spiralize_vignettes/spiralize.html#utility-functions。

3.预测模型NRI IDI

C指数、NRI IDI 是预测模型统计区分度和临床可及性常规指标。具体计算往期文章中找。

三、代码获取

免费代码获取发送： 环形柱状图  到公众号后台(别带空格)。代码和数据有效期7天，保留至8.28日，也可支付300微信豆永久有效。